Первым делом смотрим лог индексирования, если лог заканчивается фразой unsorted clattr portion, то эта заметка Вам поможет.

По-умолчанию индексатор Яндекс.Сервера пишет индексы во временную директорию, называется она newindex, а после окончания индексации переносит индекс из временной директории в директорию индекса конкретного сайта. Если прошлая индексация к примеру завершилась аварийно - файлы индекса во временной директории остались, именно это и имеет в виду ошибка unsorted clattr portion - удаляем все файлы из директории newindex и запускаем индексацию заново.

CodeIgniter предоставляет неплохие возможности по обработке ошибок, но мне они показались недостаточными по следующим причинам:

• отсутствует возможность обработки исключений
• отсутствует возможность уведомлять администратора сайта о возникающих ошибках через почту
• довольно скудная информацию о возникающих ошибках (в фреймворке с которым я работал раньше текст ошибки дополняется дампом глобальных переменных, что очень сильно облегчает процесс отладки, хотелось бы подобную схему увидеть и в CodeIgniter)

Будем это исправлять =)

Читать дальше...